Группа компаний «Акватрон» образована на базе одного из крупнейших предприятий военно-промышленного комплекса России, разработчика гидроизолирующих составов ОАО «Полиэкс».
ОАО «Полиэкс» начало свою производственную деятельность в 1959 году в качестве одного из ведущих в СССР предприятий оборонного комплекса (на тот момент предприятие называлось Бийский химический комбинат). За годы перестройки и постсоветский период благодаря масштабным конверсионным мероприятиям и программе приватизации, ОАО «Полиэкс», используя наработанный за годы своего существования опыт, стал одним из гигантов химической промышленности России.
Во второй половине XX века за границей появились составы, которые проникают в поры бетона и при взаимодействии с водой заполняют капилляры нерастворимыми кристаллами. В СССР задумались о собственной разработке в первую очередь для военных объектов. За дело взялись специалисты Бийского химического комбината — к концу 1990-х они создали несколько составов проникающих смесей из цемента, песка и активных химических добавок. Предприятием был освоен выпуск гидроизоляционных смесей семейства «Акватрон».